Som sagt är "WA" tiden processorn väntar på att I/O ska slutföras. Panelappleten är antagligen inte trasig, all tid som processorn måste vänta slukas precis som om någon process använt den. Det bidrar till en hög "load average" vilket gör att datorn förmodligen känns seg.
Förmodligen har du problem med en långsam disk (den kanske inte har udma påslaget t.ex.) eller så är det nåt program som beter sig märkligt. Ville egentligen bara tipsa om "iotop" (det måste du antagligen installera först) som visar vilka processer som har mest I/O-aktivitet och orsakar hög WA. "-a" är vettigt att köra med, så ser du inte bara temporära toppar utan ackumulerad aktivitet (vilket antagligen är mer intressant).