Sökte bara efter ett ljus i mörkret men ser inte att de ska ha med rättighterna att göra i ditt fall. Eftersom du kan skapa/ändra/ta bort filer men har problem med mappar så lutar det mer åt en bugg i Nautilus. Inte första gången i så fallpeswe skrev:Vilka rättigheter ska katalogen ha?
Vilken användare ska rättigheterna tillhöra? Ubuntu-usern? Eller ftp/ssh-usern?

När du går via t.ex ftp så blir det normalt den användaren som du loggar in som också kommer att äga de nyskapade mapparna/filerna. Kör du via telnet så blir det en defaultägare typ nobody.